Στην παρούσα πτυχιακή αναπτύσσεται το θέμα της Προτεϊνικής απεικόνισης μέσα από έξη κεφάλαια που αφορούν την βιολογική ανάπτυξη και κατ’επέκταση εκμάθηση των εννοιών DNA, RNA, Πρωτεΐνη και Αμινοξέα. Στη συνέχεια, παρουσιάζονται, περιληπτικά, εργαλεία μοριακής απεικόνισης που βοήθησαν στην τελική απόφαση επιλογής για την ανάπτυξη του εργαλείου DeepView / S–PdbViewer V4. Γίνεται μία γενική περιγραφή του παραπάνω εργαλείου και αναφέρονται παραδείγματα λειτουργίας ενώ στη συνέχεια αναπτύσσονται τα τεχνικά χαρακτηριστικά του. Κλείνοντας, φτάνουμε σε συμπεράσματα για την χρήση του παραπάνω εργαλείου και δημιουργούμε μία ικανοποιητική περιγραφή των παραρτημάτων που βρίσκονται ήδη στο διαδίκτυο και αποτελούν έγκυρη πηγή εκμάθησης.This thesis explores the subject of Protein Visualization which is developing in six chapters based on the biological growth and learning of DNA, RNA, Protein and Amino-acids definitions. The production studies in this thesis provide a brief presentation regarding the tools of molecular visualization that leads in the final choice on the growth of tool DeepView / S -PdbViewer V4. A general description of this tool and operational examples are reported, while the development of the technical characteristics is presented, reaching the final conclusion of the present analysis. In addition, on the final part of this thesis, the sources we used are presented in order to reach to our conclusions.