Ο μικροοργανισμός Streptococcus pneumoniae (πνευμονιόκοκκος) αττο-τελεί σημαντικό παθογόνο παράγοντα, κυρίως για τα παιδιά μικρής ηλικίας αλλά και για τους ηλικιωμένους. Αποικίζει το ανώτερο αναπνευστικό σύστημα και μπο-ρεί να προκαλέσει διάφορους τύπους ασθενειών όπως πνευμονία, βακτηριαιμία, μηνιγγίτιδα, οξεία μέση ωτίτιδα και παραρρινοκολπίτιδα. Η επίπτωση και η θνητότητα που παρουσιάζει ο πνευμονιόκοκκος είναι ιδιαιτέρα σημαντική, και για το λόγο αυτό η επιδημιολογική του επιτήρηση είναι αναγκαία. Η πρόληψη των πνευμονιοκοκκικών λοιμώξεων δεν είναι ιδιαίτερα εφικτή καθώς ο μικροοργανισμός αυτός διαχωρίζεται σε 90 διακριτούς ορότυπους, οι οποίοι ομαδοποιούνται σε 46 οροομάδες. Από αυτές περίπου οι δέκα είναι υπεύθυνες για τις περισσότερες διεισδυτικές νόσους, με επικρατέστερες τις οροομάδες 1,6, 14, 19 και 23. Τα εμβόλια τα οποία κυκλοφορούν εστιάζουν σε αυτούς τους ορότυπους. Η εισαγωγή του νέου πρωτεϊνικού πολυσακαχριδικού συζευγμένου εμβολίου (PCV7), το οποίο περιλαμβάνει τους ορότυπους 14, 18C, 19F, 23F, 9V, 4 και 6Β, οδήγησε αφενός στη μείωση των πνευμονιοκοκκικών λοιμώξεων, αφετέρου την αλλαγή της συχνότητας εμφάνισης των οροτύπων, καθώς ορότυποι, οι οποίοι δεν περιλαμβάνονται στο εμβόλιο είναι πλέον υπεύθυνοι για πνευμονιοκοκκικές λοιμώξεις. Η άμεση χορήγηση αντιβιοτικών σε περιπτώσεις ύποπτες για λοίμωξη από πνευμονιόκοκκο έχει ως αποτέλεσμα την αναστολή της καλλιέργειας του μικροοργανισμού με άμεση συνέπεια να μην είναι δυνατή η ταυτοποίηση του. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι η δημιουργία μιας τεχνικής, στηριζό-μενη στην μέθοδο της αλυσιδωτής αντίδρασης της πολυμεράσης (PCR), η οποία να έχει την δυνατότητα να ανιχνεύει εννέα από τους κύριους οροτύπους (4, 18C, 6Β, 23F, 19F, 19Α, 14, 3 και 1) του μικροοργανισμού Streptococcus pneumoniae τόσο σε στελέχη όσο κυρίως σε βιολογικά υλικά, όπου η καλλιέργεια δεν είναι δυνατή.Streptococcus pneumoniae still remains an important pathogen causing serious infections mainly in children but also in the elderly. It colonizes the upper respiratory system and it is responsible for illnesses ranging from mild upper respiratory infections to life-threatening diseases such as bacteremia and meningitis. The epidemiological monitoring of pneumococcal disease is necessary as the incidence and the mortality is very high. The existence of 91 immunologiacally distinct serotypes, differing in the chemical compositions of their respective polysaccharide capsules makes the prevention of the infection infeasible. The 91 pneumococcal serotypes are grouped in 46 serogroups, based on their immunological similarities. Only ten of them are responsible for the majority of the invasive pneumococcal diseases (IPD), with serogroups 1, 6, 14, 19 and 23 predominating. The currently available pneumococcal vaccines focus on these serotypes. The license of the new 7valent polysaccharide conjugate vaccine, in many countries since 2000, led to the reduction of the pneumococcal infections, but also led to the increase in infections caused by non vaccine serotypes. Taking into the account that blood and CSF cultures are often negative in patients with invasive pneumococcal disease (IPD), particularly if they have been treated with antibiotics prior to hospital admission, the objective of this study was to develop a multiplex PCR assay for the simultaneous detection of nine (1, 3, 4, 6, 14, 18, 19A, 19F and 23F) main serotypes of S. pneumoniae directly in biological fluids.