Integrated real-time PCR formats

dc.contributor.author	Καμπούρης, Μανούσος Ε.	el
dc.date.accessioned	2015-01-30T19:55:28Z
dc.date.available	2015-01-30T19:55:28Z
dc.date.issued	2015-01-30
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11400/5188
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες	*
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/	*
dc.source	http://e-jst.teiath.gr/	en
dc.subject	FRET pairs
dc.subject	Διώνυμες χρωστικές FRET
dc.subject	Real-time PCR
dc.subject	SYBR-Green
dc.subject	Post-amplification procedure
dc.subject	DNA quantification
dc.subject	Διαδικασία μετά την ενίσχυση
dc.subject	DNA ποσοτικοποίηση
dc.title	Integrated real-time PCR formats	en
heal.type	journalArticle
heal.secondaryTitle	methodological analysis and comparison of two available industry options	en
heal.classification	Medicine
heal.classification	Medical technology
heal.classification	Ιατρική
heal.classification	Ιατρική τεχνολογία
heal.classificationURI	http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh00006614
heal.classificationURI	http://zbw.eu/stw/descriptor/18252-4
heal.classificationURI	N/A-Ιατρική
heal.classificationURI	N/A-Ιατρική τεχνολογία
heal.language	en
heal.access	free
heal.recordProvider	Τεχνολογικό Εκπαιδευτικό Ίδρυμα Αθήνας. Σχολή Επαγγελμάτων Υγείας και Πρόνοιας. Τμήμα Ιατρικών Εργαστηρίων	el
heal.publicationDate	2010
heal.bibliographicCitation	Kambouris, M.E. (2010). Integrated real-time PCR formats: methodological analysis and comparison of two available industry options. "e-Journal of Science & Technology". [Online] 5(4): 1-8. Available from: http://e-jst.teiath.gr/	en
heal.abstract	The real-time PCR methodology improved profoundly the basic amplification technology; not only by permitting the digital tracking of the reaction from the very first minutes, but also by significantly compressing the time for an amplification program, through technical improvements in expendables and hardware. Two of the integrated, end-to-end solutions available in the market, the Roche and the Applied Biosystems products, also capitalize on the advances at the multi-color dyes and the melting-curve analysis to perform products discrimination and dispose of post-amplification steps, such as electrophoresis, thus further compressing time and logistics footprint of the integrated assay. They also focus on the well-proven ability of the methodology to provide accurately quantitative results, which was always a priority throughout the field of biosciences, and one rarely tackled efficiently. Electrophoresis, though, remains popular with low-end users, who find it robust, reliable, flexible and relatively cheap since expendables are low-cost and know-how is well-established. Given that high-end users prefer true high-throughput methods (such as arrays) for simultaneous assaying, which vastly outperform real-time PCR, the ease and rapidity of the latter’s results, which both are of capital diagnostic concern, remain the strongest points of the method, coupled with its quantification potential.	en
heal.abstract	Η PCR Πραγματικού Χρόνου Ανάγνωσης επέτρεψε την πολυδιάστατη βελτίωση της βασικής τεχνικής ενίσχυσης πυρηνικών οξέων. Αν και μεγάλη σημασία δίνεται την παρακολούθηση της αντίδρασης εν τω γενάσθαι, που επιτρέπει εντός ελαχίστων λεπτών την δυαδική αξιολόγηση της αντίδρασης ως θετικής ή αρνητικής, τα πλεονεκτήματα εκτείνονται πέραν και ανεξαρτήτως αυτού του βασικού γνωρίσματος. Η βασική αρετή της είναι η συμπίεση του χρόνου εκτέλεσης πρωτοκόλλων ενίσχυσης στο 20% των συμβατικών μηχανημάτων, χάρη στην βελτιωμένη σύνθεση αντιδραστηρίων, την προηγμένη κατασκευή θερμικών κυκλοποιητών και την βελτιστοποίηση περιεκτών και σωληναρίων αντίδρασης, που επιτρέπουν ταχύτατες μεταβολές της θερμοκρασίας με ομοιογενή τρόπο. Δύο από τις ολοκληρωμένες λύσεις που εμφανίστηκαν στην αγορά ήταν τα συστήματα της Roche και της Applied Biosystems. Και τα δύο βασίζουν την προώθησή τους περισσότερο στην δυνατότητα εξάλειψης μεταενισχυτικού σταδίου ανάγνωσης, στις δυνατότητες ποσοτικοποίησης των προϊόντων και στην ικανότητα διάκρισης μεταξύ διαφορετικών προϊόντων για πολυπλεκτικές ή διαζευκτικές εφαρμογές σε ένα στάδιο. Οι δυνατότητες αυτές παρέχονται από την τεχνολογία ανάλυσης καμπύλης τήξεως και τις νέες, προηγμένες και αυξημένης ευκαμψίας τεχνολογίες χρώσης. Καθώς η διακριτική ικανότητα παραμένει ιδιαίτερα χαμηλή στην εποχή των συστοιχιών και των μεθόδων υψηλού ρυθμού συνεπεξεργασίας και η κατάργηση της ηλεκτροφόρησης δεν ελκύει πολλούς από τους λιγότερο εύρωστους χρήστες που έχουν αποκτήσει υποδομή και ικανοποιητική τεχνογνωσία σε αυτή τη μέθοδο, η εμπορική προοπτική των εν λόγω προσεγγίσεων προφανώς θα στηριχθεί στην εξαιρετική ταχύτητά τους, πολύτιμη για διαγνωστική χρήση, και στην δυνατότητα ακριβούς ποσοτικοποίησης που έχει εφαρμογές σε όλο το φάσμα των βιοεπιστημών.	el
heal.publisher	Νερατζής, Ηλίας	el
heal.publisher	Σιανούδης, Ιωάννης	el
heal.journalName	e-Journal of Science & Technology	en
heal.journalName	e-Περιοδικό Επιστήμης & Τεχνολογίας	el
heal.journalType	peer-reviewed
heal.fullTextAvailability	true