Sequence basis of the serotyping and subtyping efficiency of URA-A/B PCR in cryptococcus neoformans and indications for one-way multilocus allelic shift

dc.contributor.author	Τούκας, Δημήτριος	el
dc.contributor.author	Καμπούρης, Μανούσος Ε.	el
dc.contributor.author	Γαϊτάνης, Γεώργιος	el
dc.contributor.author	Μενούνος, Παναγιώτης Γ.	el
dc.contributor.author	Βελεγράκη, Αριστέα	el
dc.date.accessioned	2015-02-02T08:37:56Z
dc.date.available	2015-02-02T08:37:56Z
dc.date.issued	2015-02-02
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11400/5422
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες	*
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/	*
dc.source	http://e-jst.teiath.gr/	en
dc.subject	Loss-Of-Heterozygosity (LOH)
dc.subject	single nucleotide polymorphism
dc.subject	Μονονουκλεοτιδικός Πολυμορφισμός (SNP)
dc.subject	Απώλεια Ετεροζυγωτίας (LOH)
dc.subject	Cryptococcus neoformans
dc.subject	URA5 gene
dc.subject	PCR
dc.subject	SSCP
dc.subject	Serotype AD
dc.subject	SNP
dc.title	Sequence basis of the serotyping and subtyping efficiency of URA-A/B PCR in cryptococcus neoformans and indications for one-way multilocus allelic shift	en
dc.title	Αλληλουχικό υπόβαθρο της οροτυποποιητικής και υποτυποποιητικής αποτελεσματικότητας της PCR με εναρκτές URA-A/B στον Cryptococcus neoformans και ενδείξεις για μονόδρομη πολλαπλή αλληλική εκτροπή	el
heal.type	journalArticle
heal.classification	Science
heal.classification	Biology
heal.classification	Επιστήμες
heal.classification	Βιολογία
heal.classificationURI	http://zbw.eu/stw/descriptor/15685-2
heal.classificationURI	http://zbw.eu/stw/descriptor/15633-0
heal.classificationURI	N/A-Επιστήμες
heal.classificationURI	N/A-Βιολογία
heal.keywordURI	http://lod.nal.usda.gov/42641
heal.language	en
heal.access	free
heal.publicationDate	2011
heal.bibliographicCitation	Toukas, D., Kambouris, M.E., Gaitanis, G., Menounos, P.G. and Velegraki, A. (2011). Sequence basis of the serotyping and subtyping efficiency of URA-A/B PCR in cryptococcus neoformans and indications for one-way multilocus allelic shift. "e-Journal of Science & Technology". [Online] 6(3): 1-12. Available from: http://e-jst.teiath.gr/	en
heal.abstract	The genetic basis of the molecular subtyping of Cryptococcus neoformans isolates, performed by PCRRFLP and PCR-SSCP methodologies led through sequencing and sequence alignment to the detection of Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) with consistent allelic status and a clear direction of allelic shifting within and among the accepted subspecies taxa (varieties and serotypes). The consensus sequence allelic status of the subtyped and serotyped isolates points to the possibility of serotype transition accomplished through a gradual allelic shift. The direction of the shift is from Serotype A to Serotype AD to Serotype D, although it is unknown whether these quantal steps can be taken by the same isolate.	en
heal.abstract	Το γενετικό υπόβαθρο της μοριακής υποτυποποίησης σε στελέχη Cryptococcus neoformans που επιτυγχάνεται με μεθοδολογία PCR-RFLP ή PCR-SSCP οδήγησε, μέσω αλληλουχοποίησης και στοίχισης αλληλουχιών στην ανίχνευση Μονονουκλεοτιδικών Πολυμορφισμών (SNP) με σταθερό αλληλικό καθεστώς και σαφή ανυσματική αλληλική εκτροπή. Εντός και μεταξύ των καθιερωμένων υποειδικών ταξινομικών βαθμίδων (ποικιλία και ορότυπος). Ο αλληλικός τύπος των κατά σύμβαση αλληλουχιών από οροτυποποιημένα και υποτυποποιημένα στελέχη υποδεικνύει την πιθανότητα οροτυπικής υποστροφής δια βαθμιαίας αλληλικής εκτροπής. Η φορά της υποστροφής είναι από τον ορότυπο Α μέσω του AD στον D, αν και παραμένει άγνωστο το αν αυτά τα βήματα μπορούν να γίνουν διαδοχικά από το ίδιο στέλεχος.	el
heal.publisher	Νερατζής, Ηλίας	el
heal.publisher	Σιανούδης, Ιωάννης	el
heal.journalName	e-Journal of Science & Technology	en
heal.journalName	e-Περιοδικό Επιστήμης & Τεχνολογίας	el
heal.journalType	peer-reviewed
heal.fullTextAvailability	true